Обязан ли заявитель каждый документ, содержащий более одного листа, представлять в регистрирующий орган в прошитом виде?


Нет. Разделом I Требований к оформлению документов, представляемых в регистрирующий орган, утвержденных приказом ФНС России, не установлены требования по прошивке документов.

Источник: Требования к оформлению документов, представляемых в регистрирующий орган, утвержденные приказом ФНС России от 25.01.2012 №ММВ-7-6/25@

Вопросы заданы на сайте налоговой службы(ФНС). Источник тут(сайт nalog.ru).